Osnovan je 1977. godine pod imenom Islamski teološki fakultet, po odluci Vrhovnog islamskog starješinstva u SFRJ, a danas je Fakultet islamskih nauka u Sarajevu najprestižnija institucija visokoškolskog islamskog obrazovanja u Evropi. Od 2013. godine Fakultet islamskih nauka je punopravna članica Univerziteta u Sarajevu.



